Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2al1nQ497L1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2al1nQ497L1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2al1nQ497L1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2al1nQ497L1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms