Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa20Q45VN2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defa20Q45VN2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Defa20Q45VN2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Defa20Q45VN2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Defa20Q45VN2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Defa20Q45VN2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms