Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Itga1Q3V3R4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itga1Q3V3R4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga1Q3V3R4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga1Q3V3R4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms