Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0W9

4930432M17Rik, RIKEN cDNA 4930432M17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930432M17RikQ3V0W9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
4930432M17RikQ3V0W9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930432M17RikQ3V0W9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930432M17RikQ3V0W9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms