Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
4930567H17RikQ3V0K5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
4930567H17RikQ3V0K5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
4930567H17RikQ3V0K5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930567H17RikQ3V0K5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms