Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnaaf3Q3UYV8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf3Q3UYV8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf3Q3UYV8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms