Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm29609Q3UU56 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm29609Q3UU56 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm29609Q3UU56 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm29609Q3UU56 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm29609Q3UU56 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm29609Q3UU56 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm29609Q3UU56 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm29609Q3UU56 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm29609Q3UU56 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm29609Q3UU56 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm29609Q3UU56 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm29609Q3UU56 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm29609Q3UU56 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm29609Q3UU56 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm29609Q3UU56 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms