Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BB287469Q3UT53 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BB287469Q3UT53 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BB287469Q3UT53 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BB287469Q3UT53 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms