Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rtl4Q3URY0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rtl4Q3URY0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rtl4Q3URY0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms