Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms