Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5460Q3UQ97 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm5460Q3UQ97 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5460Q3UQ97 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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