Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cln5Q3UMW8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cln5Q3UMW8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln5Q3UMW8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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