Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccser2Q3UHI0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccser2Q3UHI0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccser2Q3UHI0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms