Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms