Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rapgef1Q3UHC1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rapgef1Q3UHC1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rapgef1Q3UHC1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rapgef1Q3UHC1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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