Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdhd2Q3UGR5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdhd2Q3UGR5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdhd2Q3UGR5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdhd2Q3UGR5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdhd2Q3UGR5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdhd2Q3UGR5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdhd2Q3UGR5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdhd2Q3UGR5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdhd2Q3UGR5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hdhd2Q3UGR5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdhd2Q3UGR5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdhd2Q3UGR5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms