Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cops9Q3U898 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops9Q3U898 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops9Q3U898 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms