Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sec24aQ3U2P1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sec24aQ3U2P1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sec24aQ3U2P1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sec24aQ3U2P1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec24aQ3U2P1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms