Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTH7

1500011B03Rik, RIKEN cDNA 1500011B03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500011B03RikQ3TTH7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1500011B03RikQ3TTH7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1500011B03RikQ3TTH7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1500011B03RikQ3TTH7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1500011B03RikQ3TTH7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1500011B03RikQ3TTH7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1500011B03RikQ3TTH7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1500011B03RikQ3TTH7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1500011B03RikQ3TTH7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1500011B03RikQ3TTH7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1500011B03RikQ3TTH7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1500011B03RikQ3TTH7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1500011B03RikQ3TTH7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms