Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim43aQ3TL54 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim43aQ3TL54 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim43aQ3TL54 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim43aQ3TL54 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms