Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrx1Q3TL44 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrx1Q3TL44 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrx1Q3TL44 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrx1Q3TL44 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrx1Q3TL44 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrx1Q3TL44 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrx1Q3TL44 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrx1Q3TL44 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrx1Q3TL44 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrx1Q3TL44 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrx1Q3TL44 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrx1Q3TL44 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrx1Q3TL44 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrx1Q3TL44 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrx1Q3TL44 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlrx1Q3TL44 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nlrx1Q3TL44 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms