Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pdlim7Q3TJD7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pdlim7Q3TJD7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pdlim7Q3TJD7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pdlim7Q3TJD7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pdlim7Q3TJD7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms