Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cul4aQ3TCH7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cul4aQ3TCH7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul4aQ3TCH7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul4aQ3TCH7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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