Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hddc2Q3SXD3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hddc2Q3SXD3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hddc2Q3SXD3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms