Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gbp8Q2V6D6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gbp8Q2V6D6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp8Q2V6D6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp8Q2V6D6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp8Q2V6D6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms