Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlrp1aQ2LKU9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp1aQ2LKU9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Nlrp1aQ2LKU9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlrp1aQ2LKU9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlrp1aQ2LKU9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp1aQ2LKU9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp1aQ2LKU9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp1aQ2LKU9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp1aQ2LKU9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp1aQ2LKU9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp1aQ2LKU9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms