Protein–RNA interactions for Protein: Q208S0

Teddm2, Epididymal protein Me9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm2Q208S0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Teddm2Q208S0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Teddm2Q208S0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Teddm2Q208S0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Teddm2Q208S0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms