Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Samd11Q1RNF8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Samd11Q1RNF8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Samd11Q1RNF8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Samd11Q1RNF8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Samd11Q1RNF8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samd11Q1RNF8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samd11Q1RNF8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samd11Q1RNF8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Samd11Q1RNF8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Samd11Q1RNF8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samd11Q1RNF8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samd11Q1RNF8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samd11Q1RNF8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samd11Q1RNF8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Samd11Q1RNF8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms