Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpusd2Q149F1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rpusd2Q149F1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rpusd2Q149F1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpusd2Q149F1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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