Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp2b3Q0VF55 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp2b3Q0VF55 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b3Q0VF55 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b3Q0VF55 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp2b3Q0VF55 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp2b3Q0VF55 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp2b3Q0VF55 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp2b3Q0VF55 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp2b3Q0VF55 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp2b3Q0VF55 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp2b3Q0VF55 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Atp2b3Q0VF55 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp2b3Q0VF55 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms