Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc138Q0VF22 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc138Q0VF22 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc138Q0VF22 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc138Q0VF22 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133 ms