Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
StumQ0VBF8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
StumQ0VBF8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
StumQ0VBF8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
StumQ0VBF8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms