Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdf9Q07105 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdf9Q07105 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdf9Q07105 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdf9Q07105 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms