Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah2Q06986 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Siah2Q06986 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Siah2Q06986 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms