Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrstQ06666 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrstQ06666 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SrstQ06666 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrstQ06666 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrstQ06666 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrstQ06666 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrstQ06666 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrstQ06666 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms