Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb4Q02738 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb4Q02738 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb4Q02738 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gjb4Q02738 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gjb4Q02738 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb4Q02738 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjb4Q02738 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Gjb4Q02738 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb4Q02738 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms