Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd1Q02242 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdcd1Q02242 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pdcd1Q02242 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdcd1Q02242 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms