Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Thumpd3P97770 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Thumpd3P97770 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Thumpd3P97770 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Thumpd3P97770 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Thumpd3P97770 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd3P97770 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd3P97770 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd3P97770 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Thumpd3P97770 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms