Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
rp9P97762 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
rp9P97762 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
rp9P97762 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
rp9P97762 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
rp9P97762 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
rp9P97762 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
rp9P97762 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
rp9P97762 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
rp9P97762 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
rp9P97762 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
rp9P97762 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
rp9P97762 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
rp9P97762 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
rp9P97762 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
rp9P97762 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
rp9P97762 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
rp9P97762 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
rp9P97762 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
rp9P97762 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
rp9P97762 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
rp9P97762 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
rp9P97762 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
rp9P97762 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
rp9P97762 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
rp9P97762 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
rp9P97762 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
rp9P97762 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
rp9P97762 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
rp9P97762 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
rp9P97762 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
rp9P97762 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
rp9P97762 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
rp9P97762 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
rp9P97762 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
rp9P97762 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
rp9P97762 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
rp9P97762 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
rp9P97762 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
rp9P97762 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
rp9P97762 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
rp9P97762 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
rp9P97762 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
rp9P97762 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
rp9P97762 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
rp9P97762 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
rp9P97762 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
rp9P97762 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
rp9P97762 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
rp9P97762 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
rp9P97762 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
rp9P97762 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
rp9P97762 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
rp9P97762 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
rp9P97762 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
rp9P97762 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
rp9P97762 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
rp9P97762 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
rp9P97762 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
rp9P97762 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
rp9P97762 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
rp9P97762 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
rp9P97762 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
rp9P97762 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
rp9P97762 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
rp9P97762 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
rp9P97762 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
rp9P97762 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
rp9P97762 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
rp9P97762 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
rp9P97762 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
rp9P97762 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
rp9P97762 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
rp9P97762 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
rp9P97762 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
rp9P97762 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
rp9P97762 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
rp9P97762 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
rp9P97762 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
rp9P97762 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
rp9P97762 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
rp9P97762 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
rp9P97762 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
rp9P97762 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
rp9P97762 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
rp9P97762 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
rp9P97762 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
rp9P97762 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
rp9P97762 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
rp9P97762 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
rp9P97762 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
rp9P97762 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
rp9P97762 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
rp9P97762 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
rp9P97762 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
rp9P97762 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
rp9P97762 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
rp9P97762 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
rp9P97762 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
rp9P97762 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms