Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AurkaP97477 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AurkaP97477 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AurkaP97477 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AurkaP97477 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AurkaP97477 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AurkaP97477 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AurkaP97477 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AurkaP97477 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AurkaP97477 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AurkaP97477 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AurkaP97477 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AurkaP97477 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AurkaP97477 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AurkaP97477 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms