Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bop1P97452 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bop1P97452 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bop1P97452 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bop1P97452 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bop1P97452 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bop1P97452 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bop1P97452 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bop1P97452 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bop1P97452 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bop1P97452 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Bop1P97452 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bop1P97452 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bop1P97452 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms