Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig3P97386 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig3P97386 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lig3P97386 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lig3P97386 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lig3P97386 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lig3P97386 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lig3P97386 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lig3P97386 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lig3P97386 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lig3P97386 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lig3P97386 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lig3P97386 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig3P97386 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lig3P97386 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lig3P97386 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms