Protein–RNA interactions for Protein: P97363

Sptlc2, Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2P97363 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sptlc2P97363 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sptlc2P97363 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sptlc2P97363 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Sptlc2P97363 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sptlc2P97363 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms