Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vgll3P85442 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vgll3P85442 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vgll3P85442 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vgll3P85442 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms