Protein–RNA interactions for Protein: P84084

Arf5, ADP-ribosylation factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf5P84084 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arf5P84084 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arf5P84084 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arf5P84084 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arf5P84084 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arf5P84084 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arf5P84084 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arf5P84084 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arf5P84084 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arf5P84084 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arf5P84084 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Arf5P84084 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arf5P84084 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arf5P84084 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arf5P84084 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arf5P84084 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arf5P84084 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arf5P84084 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arf5P84084 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arf5P84084 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arf5P84084 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arf5P84084 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arf5P84084 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arf5P84084 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arf5P84084 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arf5P84084 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arf5P84084 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arf5P84084 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arf5P84084 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms