Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tubg1P83887 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tubg1P83887 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tubg1P83887 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms