Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptprn2P80560 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptprn2P80560 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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Ptprn2P80560 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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Ptprn2P80560 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Ptprn2P80560 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ptprn2P80560 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptprn2P80560 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms