Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh9P70407 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh9P70407 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh9P70407 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh9P70407 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh9P70407 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh9P70407 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh9P70407 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms