Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shox2P70390 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shox2P70390 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shox2P70390 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shox2P70390 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shox2P70390 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shox2P70390 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shox2P70390 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shox2P70390 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shox2P70390 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shox2P70390 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shox2P70390 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Shox2P70390 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shox2P70390 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shox2P70390 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shox2P70390 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shox2P70390 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shox2P70390 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Shox2P70390 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shox2P70390 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shox2P70390 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shox2P70390 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shox2P70390 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shox2P70390 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shox2P70390 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shox2P70390 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms