Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Chl1P70232 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chl1P70232 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Chl1P70232 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Chl1P70232 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chl1P70232 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Chl1P70232 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chl1P70232 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chl1P70232 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chl1P70232 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chl1P70232 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chl1P70232 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chl1P70232 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chl1P70232 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chl1P70232 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chl1P70232 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chl1P70232 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chl1P70232 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chl1P70232 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chl1P70232 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chl1P70232 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Chl1P70232 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chl1P70232 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Chl1P70232 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chl1P70232 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chl1P70232 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chl1P70232 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chl1P70232 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chl1P70232 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chl1P70232 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chl1P70232 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chl1P70232 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Chl1P70232 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chl1P70232 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chl1P70232 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chl1P70232 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chl1P70232 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Chl1P70232 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chl1P70232 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chl1P70232 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chl1P70232 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chl1P70232 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Chl1P70232 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chl1P70232 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chl1P70232 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chl1P70232 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chl1P70232 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chl1P70232 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chl1P70232 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chl1P70232 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chl1P70232 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chl1P70232 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chl1P70232 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chl1P70232 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chl1P70232 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Chl1P70232 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms