Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkacbP68181 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PrkacbP68181 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PrkacbP68181 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PrkacbP68181 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms