Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lsm3P62311 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lsm3P62311 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lsm3P62311 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms